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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

【坚定信心 勇毅前行⑰】贵州：形成发展合力******

　　【坚定信心 勇毅前行⑰】

　　光明日报记者 吕慎 陈冠合

　　前不久，由世界500强企业正威集团总投资119亿元的贵阳正威精密导体产业城项目和总投资50亿元的正威贵银产业园项目分别迎来项目一期投产。全国政协委员、正威集团董事局主席王文银表示，将继续在贵州加大投资，并按照“广东总部+贵州基地”“广东研发+贵州制造”“广东企业+贵州资源”“广东市场+贵州产品”的合作模式，整合优势资源、加速产业聚集、形成发展合力，为贵州的新型工业化贡献力量。

　　同一天，中航重机贵阳航空产业园项目也开工建设，这次集中开工的12个重大项目总投资211亿元，涉及智能制造、航空物流、大数据产业等领域。

　　2022年12月29日，在位于安顺市的贵州百灵企业集团制药股份有限公司车间内，一派忙碌的景象。由于近期产品供不应求，公司正在有序调度，努力跑出加速度。总经理牛民说：“我们的设备正不停机运转，1300余名员工分三班24小时不停歇作业，产能、负荷100％全力生产，每天可规模生产上万件紧缺药品，全力保障市场供应和群众需求。”

　　安顺市市长尹恒斌表示，2023年安顺市将加大对百灵制药这样的实体经济的支持力度，在创建“贵人服务”品牌的基础上狠下大功夫，当好“店小二”，全方位服务企业。同时，还将丰富招商主体、创新招商形式、拓宽招商渠道，积极引进一批符合自身产业发展实际、带动作用强、有影响力的好项目、大项目，为推动全市经济高质量发展注入更强动力。

　　《光明日报》（ 2023年01月09日 01版）

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）